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发布日期:2021-04-06 15:18:01       作者:希力药业       浏览:169

  自2021年12月起,新冠肺炎疫情已经肆虐一年有余,全球已有近1.1亿人感染,220万人死亡,防控形势依然严峻。尽管目前瑞德西韦等抗病毒药物已获准用于新冠患者,多国已有针对新冠病毒的疫苗问世,但总体来说,合成的抗病毒药物仍然存在着诸多副作用,疫苗产生的不良反应率仍然较高。在新冠肺炎疫情防控常态化的情况下,研发更安全、更有效的天然药物来抑制新冠肺炎(COVID-19)将是科学界一项重点工作。

 

  近年来,含有2-10个氨基酸的食源性多肽已被证明具有更高的吸收效率和营养功能,包括抗病毒作用,而面对种类繁多的多肽来源和结构,计算机辅助筛选是药物筛选的第一步,但目前在抑制COVID-19的食源性短肽筛选研究中还鲜有报道。本研究在团队前期研究基础上,广泛收集了植物、动物、水产品、真菌类等食源性短肽分子527个;采用分子模拟与分子对接的方法探究了短肽与ACE2、Mpro、RdRp等三个关键靶点的相互作用,通过计算和对比相互作用力,成功筛选出187个能够作用于Covid-19病毒的三个关键靶点的短肽,并获得了79个具有较高非共价相互作用的短肽,其中6个短肽可以同时对这三个靶点有高抑制活性。同时研究发现,短肽抑制三个关键靶点的主要作用力包括静电作用力(盐桥)、氢键、金属作用力、Pi-Pi堆叠作用,抑制活性最高的三个肽PA1、PM1、PR1,其总相互作用力为-330.556 kcal/mol、-366.214 kcal/mol、-870.287 kcal/mol,高于已报道的阳性药物(MLN-4760、Ritonavir、Remdesivir),此外,借助分子动力学模拟,对三个靶点具有高抑制活性的短肽进行系统分析,初步掌握了高抑制活性短肽的结构特点,为基于天然功能成分的Covid-19病毒抑制分子的开发和利用提供支撑。

 

  该成果在线发表在《Biomolecules(二区,4.082)》上,得到了中国农业科学院科技创新工程院所重点任务(CAAS-ASTIP-2021-IFST)项目资助。